Новости
Школа
Доска объявлений
Программы обучения
Студентам
Абитуриентам
Ru
/En
En
Ru

Директор физтех-школы биологической и медицинской физики
Кандидат биологических наук.

Команда

Кузьмин Денис Владимирович

Часы приема:
Пн: 12:00-13:00
Эл. почта:
kuzmin.dv@mipt.ru
Написать на почту

Образование

2017-2019: Московская Школа Управления СКОЛКОВО. MBA.

2007-2011: Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, лаборатория структуры и функции генов человека. Кандидат биологических наук по специальности «Молекулярная биология».

2002-2007: Московский Государственный Университет им М.В. Ломоносова, специальность «Биохимия».

Знание языков:

Русский – родной

Английский – свободное владение


Профессиональный опыт:
2016-2019
ООО «Виридиас» (портфельная компания РОСНАНО). Генеральный директор. Биотехнологический стартап по разработке и внедрению в клиническую практику антибиотиков нового поколения против метициллин-резистентного стафилококка. Компания успешно привлекла финансирование от I2BF-Rusnano Strategic Recourses Fund и фонда «Сколково». В рамках Start-Up Village проект «Виридиас» занял второе место среди всех участников конкурса (2017 г.).
2014-2019
ООО «Соликсант» (портфельная компания РОСНАНО). Генеральный директор и член Совета директоров. Организация деятельности российского подразделения американской компании Solix Algredients Inc.; реализация трансфера технологии в РФ – импорт и локализация фотобиореакторов Solix серии «Lumia AGS260», не имеющих аналогов в РФ; организация скрининга штаммов микроводорослей из коллекции всех ведущих НИИ на предмет наличия веществ с высоким потенциалом коммерциализации в области биологически активных добавок.
ООО «Соликсант» было успешно выделено в самостоятельную компанию и привлекло финансирование от I2BF-Rusnano Strategic Recourses Fund и фонда «Сколково». В рамках деятельности ООО «Соликсант» был запущен спин-офф проект «Pond Superfoods» – производство биологически активной добавки на основе спирулины. Продукт был выведен в крупнейшие ритейл и аптечные сети РФ.
2013-2019
Учебно-научный Центр ИБХ РАН. Руководитель научной группы. Разработка противоопухолевых препаратов молекулярно-направленного действия на основе антимикробных пептидов животных.
2009-2014
Независимая лаборатория «ИНВИТРО». Работа по модели франчайзинга.
Создание и управление сетью медицинских центров, привлечение инвестиций, финансовое и стратегическое планирование; выведение на рынок СНГ инновационных молекулярно-генетических методов диагностики; запуск и реализация совместных федеральных программ
с Минздравсоцразвития.
Основные публикации:
  1. Rabushko E, Sorokin M, Suntsova M, Seryakov AP, Kuzmin DV, Poddubskaya E, Buzdin AA. Experimentally Deduced Criteria for Detection of Clinically Relevant Fusion 3′ Oncogenes from FFPE Bulk RNA Sequencing Data. Biomedicines. 2022; 10(8):1866. https://doi.org/10.3390/biomedicines10081866
  2. Zolotovskaia, M., Kovalenko, M.A., Tkachev, V., Simonov, A., Sorokin, M., Kim, E., Kuzmin, D., Karademir-Yilmaz, B., Buzdin, A.A. Next-Generation Grade and Survival Expression Biomarkers of Human Gliomas Based on Algorithmically Reconstructed Molecular Pathways (2022) International Journal of Molecular Sciences, 23 (13).
  3. Raevskiy, M., Sorokin, M., Zakharova, G., Tkachev, V., Borisov, N., Kuzmin, D., Kremenchutckaya, K., Gudkov, A., Kamashev, D., Buzdin, A. Better Agreement of Human Transcriptomic and Proteomic Cancer Expression Data at the Molecular Pathway Activation Level(2022) International Journal of Molecular Sciences, 23 (5), art. no. 2611,
  4. Zolotovskaia, M.A., Tkachev, V.S., Guryanova, A.A., Simonov, A.M., Raevskiy, M.M., Efimov, V.V., Wang, Y., Sekacheva, M.I., Garazha, A.V., Borisov, N.M., Kuzmin, D.V., Sorokin, M.I., Buzdin, A.A. OncoboxPD: human 51 672 molecular pathways database with tools for activity calculating and visualization (2022) Computational and Structural Biotechnology Journal, 20, pp. 2280-2291.
  5. Sorokin, M., Gorelyshev, A., Efimov, V., Zotova, E., Zolotovskaia, M., Rabushko, E., Kuzmin, D., Seryakov, A., Kamashev, D., Li, X., Poddubskaya, E., Suntsova, M., Buzdin, A. RNA Sequencing Data for FFPE Tumor Blocks Can Be Used for Robust Estimation of Tumor Mutation Burden in Individual Biosamples(2021) Frontiers in Oncology, 11, art. no. 732644, . DOI: 10.3389/fonc.2021.732644
  6. Sorokin, M., Raevskiy, M., Zottel, A., Šamec, N., Vidmar, M.S., Matjašič, A., Zupan, A., Mlakar, J., Suntsova, M., Kuzmin, D.V., Buzdin, A., Jovčevska, I. Large-scale transcriptomics-driven approach revealed overexpression of crnde as a poor survival prognosis biomarker in glioblastoma (2021) Cancers, 13 (14), art. no. 3419, . DOI: 10.3390/cancers13143419
  7. Zolotovskaia, M., Tkachev, V., Sorokin, M., Garazha, A., Kim, E., Kantelhardt, S.R., Bikar, S.-E., Zottel, A., Šamec, N., Kuzmin, D., Sprang, B., Moisseev, A., Giese, A., Efimov, V., Jovčevska, I., Buzdin, A. Algorithmically deduced FREM2 molecular pathway is a potent grade and survival biomarker of human gliomas(2021) Cancers, 13 (16), art. no. 4117, DOI: 10.3390/cancers13164117
  8. Sorokin M, Borisov N., Kuzmin D, Gudkov A., Zolotovskaia M, Garazha A, Buzdin A. Algorithmic Annotation of Functional Roles for Components of 3,044 Human Molecular Pathways, Frontiers in Genetics, 12, art. no. 617059 Open AccessVolume 129 February 2021 Article number 617059, doi:10.3389/fgene.2021.617059
  9. Kamashev, D., Sorokin, M., Kochergina, I., Drobyshev, A., Vladimirova, U., Zolotovskaia, M., Vorotnikov, I., Shaban, N., Raevskiy, M., Kuzmin, D., Buzdin, A. Human blood serum can donor-specifically antagonize effects of EGFR-targeted drugs on squamous carcinoma cell growth (2021) Heliyon, 7 (3), art. no. e06394
  10. Sorokin, M., Kholodenko, I., Kalinovsky, D., Shamanskaya, T., Doronin, I., Konovalov, D., Mironov, A., Kuzmin, D., Nikitin, D., Deyev, S., Buzdin, A., Kholodenko, R. RNA sequencing-based identification of ganglioside GD2-positive cancer phenotype(2020) Biomedicines, 8 (6), art. no. 142
  11. Zolotovskaia MA, Tkachev VS, Seryakov AP, Kuzmin DV, Kamashev DE, Sorokin MI, Roumiantsev SA, Buzdin AA. Mutation Enrichment and Transcriptomic Activation Signatures of 419 Molecular Pathways in Cancer. Cancers (Basel). 2020 Jan 22;12(2). pii: E271. doi: 10.3390/cancers12020271
  12. Zolotovskaia MA, Sorokin MI, Emelianova AA, Borisov NM, Kuzmin DV, Borger P, Garazha AV, Buzdin AA. Pathway Based Analysis of Mutation Data Is Efficient for Scoring Target Cancer Drugs. Front Pharmacol.2019 Jan 23;10:1. doi: 10.3389/fphar.2019.00001.
  13. Anna A. Emelianova, Denis V. Kuzmin, Pavel V. Panteleev, Maxim Sorokin, Anton A. Buzdin and Tatiana V. Ovchinnikova. Anticancer Activity of the Goat Antimicrobial Peptide ChMAP-28. Front Pharmacol. 2018; 9: 1501
  14. Maltsev, Y., Gusev, E., Maltseva, I., Kulikovskiy, M., Namsaraev, Z., Petrushkina, M., Filimonova, A., Sorokin, B., Golubeva, A., Butaeva, G., Khrushchev, A., Zotko, N., Kuzmin, D. Description of a new species of soil algae, Parietochloris grandis sp. nov., and study of its fatty acid profiles under different culturing condition. (2018) Algal Research, 33, pp. 358-368.
  15. Marggraf MB, Panteleev PV, Emelianova AA, Sorokin MI, Bolosov IA, Buzdin AA, Kuzmin DV, Ovchinnikova TV. Cytotoxic Potential of the Novel Horseshoe Crab Peptide Polyphemusin III Mar Drugs (2018), 16 (12).
  16. Mamaeva A, Namsaraev Z, Maltsev Y, Gusev E, Kulikovskiy M, Petrushkina M, Filimonova A, Sorokin B, Zotko N, Vinokurov V, Kopitsyn D, Petrova D, Novikov A, and Kuzmin D. Simultaneous increase in cellular content and volumetric concentration of lipids in bracteacoccus bullatus cultivated at reduced nitrogen and phosphorus concentrations. Journal of Applied Phycology, 2018. DOI: 10.1007/s10811-018-1471-9
  17. Kuzmin DV, Emelianova AA, Kalashnikova MB, Panteleev PV, Ovchinnikova TV. In Vitro Study of Antitumor Effect of Antimicrobial Peptide Tachyplesin I in Combination with Cisplatin I. Bull Exp Biol Med. 2018 June. doi: 10.1007/s10517-018-4134-6.
  18. Kuzmin DV, Emelianova AA, Kalashnikova MB, Panteleev PV, Balandin SV, Serebrovskaya EO, Belogurova-Ovchinnikova OY, Ovchinnikova TV. Comparative in vitro study on cytotoxicity of recombinant β-hairpin peptides. Chem Biol Drug Des. 2018, Vol 91, Nо 1, pp 294-303
  19. Sorokin M, Kholodenko R, Grekhova A, Suntsova M, Pustovalova M, Vorobyeva N, Kholodenko I, Malakhova G, Garazha A, Nedoluzhko A, Vasilov R, Poddubskaya E, Kovalchuk O, Adamyan L1, Prassolov V, Allina D, Kuzmin D, Ignatev K, Osipov A, Buzdin A. Acquired resistance to tyrosine kinase inhibitors may be linked with the decreased sensitivity to X-ray irradiation. Oncotarget. 2017 Dec 27;9(4):5111-5124 IF 5.1
  20. Kuzmin DV, Emelianova AA, Kalashnikova MB, Panteleev PV, Ovchinnikova TV. Effect of N- and C-terminal modifications on cytotoxic properties of antimicrobial peptide tachyplesin I. Bull Exp Biol Med. 2017 Apr;162(6):754-757. doi: 10.1007/s10517-017-3705-2.
  21. Petrushkina, M., Gusev, E., Sorokin, B., Zotko, N., Mamaeva, A., Filimonova, A., Kulikovskiy.M., Maltsev E., Yampolsky I., Guglya E., Vinokurov V., Namsaraev Z.,Kuzmin D. Fucoxanthin production by heterokont microalgae. Algal Research.№24.2017. P.387-393.
  22. Artcibasova AV, Korzinkin MB, Sorokin MI, Shegay PV, Zhavoronkov AA, Gaifullin N, Alekseev BY, Vorobyev NV, Kuzmin DV, Kaprin АD, Borisov NM, Buzdin AA. MiRImpact, a new bioinformatic method using complete microRNA expression profiles to assess their overall influence on the activity of intracellular molecular pathways.Cell Cycle. 2016;15(5):689-98. doi: 10.1080/15384101.2016.1147633
  23. Denis V. Kuzmin, Tatyana V. Vinogradova, Eugene P. Kopantzev and Eugene D. Sverdlov. Cre-LoxP Mediated Strong Enhancement of pBIRC5 Promoter Driven Suicide of Cancer Cells with CD/UPRT and Fluorocytosine. The Open Gene Therapy Journal, 2010, 3, 31-39.
  24. Kuzmin D, Gogvadze E, Kholodenko R, Grzela DP, Mityaev M, Vinogradova T, Kopantzev E, Malakhova G, Suntsova M, Sokov D, Ivics Z, Buzdin A. Novel strong tissue specific promoter for gene expression in human germ cells. BMC Biotechnol. 2010 Aug 17;10:58. doi: 10.1186/1472-6750-10-58.
  25. D. K. Slizhikova, M. V. Zinovyeva, D. V. Kuzmin, E. V. Snezhkov, M. I. Shakhparonov, R. I. Dmitriev, N.V. Antipova, L. L. Zavalova, E. D. Sverdlov. Decreased expression of the human immunoglobulin J-chain gene in squamous cell cancer and adenocarcinoma of the lungs. Mol Biol (Mosk). 2007 Jul-Aug;41(4):659-65.
  26. Alekseenko I.V., Kuzmin, D.V., Pleshkan, V.V., Zinovyeva, M.V., Sverdlov E.D. Cytotoxicities of cytosine deaminase and herpes simplex virus thymidine kinase genes in melanoma cells are not affected by the promoter strength Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 2013, 39 (6): 745-748.