Профессиональные интересы/научные проекты:
Научные исследования, основанные на использовании комплексных, интегративных подходов, направленных на характеристику и установление роли генетических и эпигенетических факторов в патогенезе социально-значимых заболеваний, в комплексной оценке состояния здоровья, оценке спортивного потенциала.
В НИР, выполняющихся в течение последних 5 лет активно используются методы полногеномного анализа: высокоплотное генотипирование на платформе ДНК-чипов (Illumina) с плотностью покрытия до 5 млн. SNP; полногеномный анализ метилирования ДНК на платформе HumanMethylation450 и HumanMethylation Epic BeadChip (Illumina); анализ геномов и экзомов с использованием технологии секвенирования нового поколения (NGS) – IonProton, Illumina HiSeq2500.
Основные темы научного интереса: ассоциативные генетические исследования для оценки физического потенциала; эпигенетические исследования по онкологической тематике, анализ данных полноэкзомного секвенирования, технологии персонифицированной медицины, популяционная генетика.
Разработаны оригинальные биоинформационные подходы для обработки и аннотации данных секвенирования, получаемых с использованием секвенаторов нового поколения, высокоплотных ДНК-чипов.
В НИР, выполняющихся в течение последних 5 лет активно используются методы полногеномного анализа: высокоплотное генотипирование на платформе ДНК-чипов (Illumina) с плотностью покрытия до 5 млн. SNP; полногеномный анализ метилирования ДНК на платформе HumanMethylation450 и HumanMethylation Epic BeadChip (Illumina); анализ геномов и экзомов с использованием технологии секвенирования нового поколения (NGS) – IonProton, Illumina HiSeq2500.
Основные темы научного интереса: ассоциативные генетические исследования для оценки физического потенциала; эпигенетические исследования по онкологической тематике, анализ данных полноэкзомного секвенирования, технологии персонифицированной медицины, популяционная генетика.
Разработаны оригинальные биоинформационные подходы для обработки и аннотации данных секвенирования, получаемых с использованием секвенаторов нового поколения, высокоплотных ДНК-чипов.
Основные публикации:
1.Turner DC, Gorski PP, Maasar MF, Seaborne RA, Baumert P, Brown AD, Kitchen MO, Erskine RM, Dos-Remedios I, Voisin S, Eynon N, Sultanov RI, Borisov OV, Larin AK, Semenova EA, Popov DV, Generozov EV, Stewart CE, Drust B, Owens DJ, Ahmetov II, Sharples AP. DNA methylation across the genome in aged human skeletal muscle tissue and muscle-derived cells: the role of HOX genes and physical activity. Sci Rep. 2020 Sep 21;10(1):15360. doi: 10.1038/s41598-020-72730-z. PMID: 32958812; PMCID: PMC7506549.
2.Seaborne RA, Hughes DC, Turner DC, Owens DJ, Baehr LM, Gorski P, Semenova EA, Borisov OV, Larin AK, Popov DV, Generozov EV, Sutherland H, Ahmetov II, Jarvis JC, Bodine SC, Sharples AP. UBR5 is a novel E3 ubiquitin ligase involved in skeletal muscle hypertrophy and recovery from atrophy. J Physiol. 2019 Jul;597(14):3727-3749. doi: 10.1113/JP278073. Epub 2019 Jun 11. PMID: 31093990.
3.Babalyan K, Sultanov R, Generozov E, Sharova E, Kostryukova E, Larin A, Kanygina A, Govorun V, Arapidi G. LogLoss-BERAF: An ensemble-based machine learning model for constructing highly accurate diagnostic sets of methylation sites accounting for heterogeneity in prostate cancer. PLoS One. 2018 Nov 2;13(11):e0204371. doi: 10.1371/journal.pone.0204371. PMID: 30388122; PMCID: PMC6214495.
4.Livshits MA, Khomyakova E, Evtushenko EG, Lazarev VN, Kulemin NA, Semina SE, Generozov EV, Govorun VM. Isolation of exosomes by differential centrifugation: Theoretical analysis of a commonly used protocol. Sci Rep. 2015 Nov 30;5:17319. doi: 10.1038/srep17319. Erratum in: Sci Rep. 2016;6:21447. Livshts, Mikhail A [corrected to Livshits, Mikhail A]. PMID: 26616523; PMCID: PMC4663484.
5.Al-Khelaifi F, Yousri NA, Diboun I, Semenova EA, Kostryukova ES, Kulemin NA, Borisov OV, Andryushchenko LB, Larin AK, Generozov EV, Miyamoto-Mikami E, Murakami H, Zempo H, Miyachi M, Takaragawa M, Kumagai H, Naito H, Fuku N, Abraham D, Hingorani A, Donati F, Botrè F, Georgakopoulos C, Suhre K, Ahmetov II, Albagha O, Elrayess MA. Genome-Wide Association Study Reveals a Novel Association Between MYBPC3 Gene Polymorphism, Endurance Athlete Status, Aerobic Capacity and Steroid Metabolism. Front Genet. 2020 Jun 16;11:595. doi: 10.3389/fgene.2020.00595. PMID: 32612638; PMCID: PMC7308547.
6.Moreland E, Borisov OV, Semenova EA, Larin AK, Andryushchenko ON, Andryushchenko LB, Generozov EV, Williams AG, Ahmetov II. Polygenic Profile of Elite Strength Athletes. J Strength Cond Res. 2020 Dec 3. doi: 10.1519/JSC.0000000000003901. Epub ahead of print. PMID: 33278272.
7.Guilherme JPLF, Bosnyák E, Semenova EA, Szmodis M, Griff A, Móra Á, Almási G, Trájer E, Udvardy A, Kostryukova ES, Borisov OV, Larin AK, Andryushchenko LB, Akimov EB, Generozov EV, Ahmetov II, Tóth M, Junior AHL. The MCT1 gene Glu490Asp polymorphism (rs1049434) is associated with endurance athlete status, lower blood lactate accumulation and higher maximum oxygen uptake. Biol Sport. 2021 Sep;38(3):465-474. doi: 10.5114/biolsport.2021.101638. Epub 2020 Dec 22. PMID: 34475628; PMCID: PMC8329966.
2.Seaborne RA, Hughes DC, Turner DC, Owens DJ, Baehr LM, Gorski P, Semenova EA, Borisov OV, Larin AK, Popov DV, Generozov EV, Sutherland H, Ahmetov II, Jarvis JC, Bodine SC, Sharples AP. UBR5 is a novel E3 ubiquitin ligase involved in skeletal muscle hypertrophy and recovery from atrophy. J Physiol. 2019 Jul;597(14):3727-3749. doi: 10.1113/JP278073. Epub 2019 Jun 11. PMID: 31093990.
3.Babalyan K, Sultanov R, Generozov E, Sharova E, Kostryukova E, Larin A, Kanygina A, Govorun V, Arapidi G. LogLoss-BERAF: An ensemble-based machine learning model for constructing highly accurate diagnostic sets of methylation sites accounting for heterogeneity in prostate cancer. PLoS One. 2018 Nov 2;13(11):e0204371. doi: 10.1371/journal.pone.0204371. PMID: 30388122; PMCID: PMC6214495.
4.Livshits MA, Khomyakova E, Evtushenko EG, Lazarev VN, Kulemin NA, Semina SE, Generozov EV, Govorun VM. Isolation of exosomes by differential centrifugation: Theoretical analysis of a commonly used protocol. Sci Rep. 2015 Nov 30;5:17319. doi: 10.1038/srep17319. Erratum in: Sci Rep. 2016;6:21447. Livshts, Mikhail A [corrected to Livshits, Mikhail A]. PMID: 26616523; PMCID: PMC4663484.
5.Al-Khelaifi F, Yousri NA, Diboun I, Semenova EA, Kostryukova ES, Kulemin NA, Borisov OV, Andryushchenko LB, Larin AK, Generozov EV, Miyamoto-Mikami E, Murakami H, Zempo H, Miyachi M, Takaragawa M, Kumagai H, Naito H, Fuku N, Abraham D, Hingorani A, Donati F, Botrè F, Georgakopoulos C, Suhre K, Ahmetov II, Albagha O, Elrayess MA. Genome-Wide Association Study Reveals a Novel Association Between MYBPC3 Gene Polymorphism, Endurance Athlete Status, Aerobic Capacity and Steroid Metabolism. Front Genet. 2020 Jun 16;11:595. doi: 10.3389/fgene.2020.00595. PMID: 32612638; PMCID: PMC7308547.
6.Moreland E, Borisov OV, Semenova EA, Larin AK, Andryushchenko ON, Andryushchenko LB, Generozov EV, Williams AG, Ahmetov II. Polygenic Profile of Elite Strength Athletes. J Strength Cond Res. 2020 Dec 3. doi: 10.1519/JSC.0000000000003901. Epub ahead of print. PMID: 33278272.
7.Guilherme JPLF, Bosnyák E, Semenova EA, Szmodis M, Griff A, Móra Á, Almási G, Trájer E, Udvardy A, Kostryukova ES, Borisov OV, Larin AK, Andryushchenko LB, Akimov EB, Generozov EV, Ahmetov II, Tóth M, Junior AHL. The MCT1 gene Glu490Asp polymorphism (rs1049434) is associated with endurance athlete status, lower blood lactate accumulation and higher maximum oxygen uptake. Biol Sport. 2021 Sep;38(3):465-474. doi: 10.5114/biolsport.2021.101638. Epub 2020 Dec 22. PMID: 34475628; PMCID: PMC8329966.
SPIN РИНЦ:
9986-7842
Researcher ID:
U-3431-2017
Scopus Author ID:
57201982531
ORCID:
0000-0002-6314-4883
Индекс Хирша:
11