Новости
Школа
Доска объявлений
Программы обучения
Студентам
Абитуриентам
Ru
/En
En
Ru

PhD, к.б.н.

Научный руководитель

Киров Илья Владимирович

Основное место работы:

ФГБНУ ВНИИСБ

Написать на почту

Контакты:

kirovez@gmail.com

Профессиональные интересы/научные проекты:

Моя сфера интересов - это мобильные элементы генома. Мы реализуем научные проекты, направленные на исследование эволюции и биологии мобилома, особенностей новых инсерций и их эффекта на транскриптомный и эпигеномный уровни. Мы разрабатываем биоинформатические алгоритмы и молекулярные методы для поиска новых инсерций, изучения транскрипции мобильных элементов в нормальных и стрессовых условиях, а также идентификации транспозиционно активных мобильных элементов растений. Полученные знания мы применяем для разработки новых методов управления и активации мобилома растений с целью расширения генетического и фенотипического разнообразия сельскохозяйственных растений. Нами создаются генетические коллекции подсолнечника, рапса, сои и томата, отличающихся новыми эпигенетическими модификациями и имеющие новые инсерции транспозонов. Такие коллекции создаются в сотрудничестве с ведущим селекционными компаниями и будут использованы для ускорения селекционного процесса.
Основные публикации:
  1. Kirov I, Kolganova E, Dudnikov M, Yurkevich OY, Amosova AV, Muravenko OV. A Pipeline NanoTRF as a New Tool for De Novo Satellite DNA Identification in the Raw Nanopore Sequencing Reads of Plant Genomes. Plants (Basel). 2022 Aug 12;11(16):2103. doi: 10.3390/plants11162103. PMID: 36015406; PMCID: PMC9413040.
  2. Kirov I, Merkulov P, Dudnikov M, Polkhovskaya E, Komakhin RA, Konstantinov Z, Gvaramiya S, Ermolaev A, Kudryavtseva N, Gilyok M, Divashuk MG, Karlov GI, Soloviev A. Transposons Hidden in Arabidopsis thaliana Genome Assembly Gaps and Mobilization of Non-Autonomous LTR Retrotransposons Unravelled by Nanotei Pipeline. Plants (Basel). 2021 Dec 6;10(12):2681. doi: 10.3390/plants10122681. PMID: 34961152; PMCID: PMC8704663.
  3. Penin AA, Kasianov AS, Klepikova AV, Kirov IV, Gerasimov ES, Fesenko AN, Logacheva MD. High-Resolution Transcriptome Atlas and Improved Genome Assembly of Common Buckwheat, Fagopyrum esculentum. Front Plant Sci. 2021 Mar 16;12:612382. doi: 10.3389/fpls.2021.612382. PMID: 33815435; PMCID: PMC8010679.
  4. Kirov I, Omarov M, Merkulov P, Dudnikov M, Gvaramiya S, Kolganova E, Komakhin R, Karlov G, Soloviev A. Genomic and Transcriptomic Survey Provides New Insight into the Organization and Transposition Activity of Highly Expressed LTR Retrotransposons of Sunflower (Helianthus annuus L.). Int J Mol Sci. 2020 Dec 7;21(23):9331. doi: 10.3390/ijms21239331. PMID: 33297579; PMCID: PMC7730604.
  5. Kirov I, Odintsov S, Omarov M, Gvaramiya S, Merkulov P, Dudnikov M, Ermolaev A, Van Laere K, Soloviev A, Khrustaleva L. Functional Allium fistulosum Centromeres Comprise Arrays of a Long Satellite Repeat, Insertions of Retrotransposons and Chloroplast DNA. Front Plant Sci. 2020 Oct 23;11:562001. doi: 10.3389/fpls.2020.562001. PMID: 33193489; PMCID: PMC7644871.
  6. Hibrand Saint-Oyant L, Ruttink T, Hamama L, Kirov I, Lakhwani D, Zhou NN, Bourke PM, Daccord N, Leus L, Schulz D, Van de Geest H, Hesselink T, Van Laere K, Debray K, Balzergue S, Thouroude T, Chastellier A, Jeauffre J, Voisine L, Gaillard S, Borm TJA, Arens P, Voorrips RE, Maliepaard C, Neu E, Linde M, Le Paslier MC, Bérard A, Bounon R, Clotault J, Choisne N, Quesneville H, Kawamura K, Aubourg S, Sakr S, Smulders MJM, Schijlen E, Bucher E, Debener T, De Riek J, Foucher F. A high-quality genome sequence of Rosa chinensis to elucidate ornamental traits. Nat Plants. 2018 Jul;4(7):473-484. doi: 10.1038/s41477-018-0166-1. Epub 2018 Jun 11. PMID: 29892093; PMCID: PMC6786968.
  7. Fesenko I, Kirov I, Kniazev A, Khazigaleeva R, Lazarev V, Kharlampieva D, Grafskaia E, Zgoda V, Butenko I, Arapidi G, Mamaeva A, Ivanov V, Govorun V. Distinct types of short open reading frames are translated in plant cells. Genome Res. 2019 Sep;29(9):1464-1477. doi: 10.1101/gr.253302.119. Epub 2019 Aug 6. PMID: 31387879; PMCID: PMC6724668.
SPIN РИНЦ:
699801
Researcher ID:
G-2570-2019
Scopus Author ID:
55548663200
ORCID:
0000-0003-3885-3837
Индекс Хирша:
11