Клинк Галина Викторовна

Моя область науки - молекулярная эволюция. Я специализируюсь на решении задач в этой области с использованием филогенетических деревьев.

В частности, занимаюсь разработкой и применением методов поиска различий адаптивного ландшафта между кладами филогенетического дерева - другими словами, я ищу
изменение эффектов мутаций в ходе эволюции.

Два основных текущих проекта - определение степени непостоянства адаптивного ландшафта SARS-CoV2 и разработка метода поиска узлов филогенетического дерева, на которых менялся адаптивный ландшафт. Также веду небольшие проекты в области геномной эпидемиологии.

1) Klink GV, Safina KR, Nabieva E, Shvyrev N, Garushyants S, Alekseeva E, Komissarov AB, Danilenko DM, Pochtovyi AA, Divisenko EV, Vasilchenko LA, Shidlovskaya EV, Kuznetsova NA; Coronavirus Russian Genetics Initiative (CoRGI) Consortium; Speranskaya AS, Samoilov AE, Neverov AD, Popova AV, Fedonin GG; CRIE Consortium; Akimkin VG, Lioznov D, Gushchin VA, Shchur V, Bazykin GA. The rise and spread of the SARS-CoV-2 AY.122 lineage in Russia. Virus Evol. 2022 Mar 5;8(1):veac017. doi: 10.1093/ve/veac017. PMID: 35371558; PMCID: PMC8966696.

2) Klink GV, Kalinina OV, Bazykin GA. Phylogenetic inference of changes in amino acid propensities with single-position resolution. PLoS Comput Biol. 2022 Feb 18;18(2):e1009878. doi: 10.1371/journal.pcbi.1009878. PMID: 35180226; PMCID: PMC9106220.

3) Biba D, Klink G, Bazykin GA. Pairs of Mutually Compensatory Frameshifting Mutations Contribute to Protein Evolution. Mol Biol Evol. 2022 Mar 2;39(3):msac031. doi: 10.1093/molbev/msac031. PMID: 35137193; PMCID: PMC8935012.

4) Matsvay A, Klink GV, Safina KR, Nabieva E, Garushyants SK, Biba D, Bazykin GA, Mikhaylov IM, Say AV, Zakamornaya AI, Khakhina AO, Lisitsa TS, Ayginin AA, Abramov IS, Bogdan SA, Kolbutova KB, Oleynikova DU, Avdeenko TF, Shipulin GA, Yudin SM, Skvortsova VI. Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Russia reveals recurring cross-border transmission throughout 2020. PLoS One. 2023 May 16;18(5):e0285664. doi: 10.1371/journal.pone.0285664. PMID: 37192187; PMCID: PMC10187899.

5) Klink GV, Danilenko D, Komissarov AB, Yolshin N, Shneider O, Shcherbak S, Nabieva E, Shvyrev N, Konovalova N, Zheltukhina A, Fadeev A, Komissarova K, Ksenafontov A, Musaeva T, Eder V, Pisareva M, Nekrasov P, Shchur V, Bazykin GA, Lioznov D. An Early SARS-CoV-2 Omicron Outbreak in a Dormitory in Saint Petersburg, Russia. Viruses. 2023 Jun 22;15(7):1415.doi: 10.3390/v15071415. PMID: 37515103; PMCID: PMC10385080.

6) Klink GV, O'Keefe H, Gogna A, Bazykin GA, Elson JL. A broad comparative genomics approach to understanding the pathogenicity of Complex I mutations. Sci Rep. 2021 Oct 1;11(1):19578. doi: 10.1038/s41598-021-98360-7. PMID: 34599203; PMCID: PMC8486755.