Анализ данных NGS

Прикладные аспекты анализа данных высокопроизводительного секвенирования (NGS)

Анализ
данных NGS

Мы рекомендуем этот курс :
Врачам
Врачи работающие в области персонализированной медицины, которые хотят лучше понимать геномные данные и их интерпретацию
Оставить заявку
Программистам
Программисты* и разработчики, заинтересованные в применении своих навыков в биомедицинских исследованиях
Оставить заявку
Молодым ученым
Исследователи и молодые ученые, которые хотят интегрировать методы биоинформатики в свои научные проекты, работающие в области системной биологии, молекулярной или медицинской генетики
Оставить заявку
Аспирантам
Аспиранты, работающие над проектами, где требуются навыки анализа больших данных
Оставить заявку
Студентам
Студенты биологических, медицинских, биотехнологических и смежных специальностей, желающие углубить свои знания в области биоинформатики
Оставить заявку
*дарим предзаписанный материал по основам молекулярной биологии
Онлайн

Формат

2 месяца

Длительность

Удостоверение МФТИ

По итогам обучения

Программа
курса

ChIP-Seq

RNA-Seq

Основа языка R

Командная строка Linux

Полнометагеномное секвенирование

Технологии высокопроизводительного секвенирования

Ресеквенирование

De novo сборка геномов и транскриптомов

Обработка результатов секвенирования

Обработка результатов полноэкзомного секвенирования. Подбор праймеров

А по итогам курса сертификат

72 ак. часа

Преподаватели совместно со студентами выполняют работу на вычислительном кластере МФТИ: устанавливают программы, запускают скрипты, разбирают результаты работы и часто встречающиеся при использовании ошибки

Работа с наставником

Студенты под руководством наставника обрабатывают "сырые" данные высокопроизводительного секвенирования, проводят сборку геномных последовательностей, анализируют экспрессию генов, занимаются поиском мутаций и др.

Проектная работа

Лекционные занятия, которые дают необходимую базу для выполнения практических работ

30%

Теоретический блок

30%

30%

Особенности нашего дополнительного профессионального образования

Удостоверение о повышении квалификации гос. образца
Онлайн-занятия в вечернее время без отрыва от основной деятельности слушателя

Онлайн чат и живое общение с преподавателями

Различные виды NGS-данных, актуальные примеры из научной практики
Высокий уровень экспертизы преподавателей
Срок обучения — два месяца

Что говорят наши студенты о программе

Я смотрела записи занятий по вечерам после пар. Особенно мне понравились занятия от Алексея Ковтуна и практические домашние задания. В целом круто, что была возможность самому поработать с данными. Самое классное, что мы сами устанавливали на сервер нужные программы для обработки данных, потому что обычно все уже предустановлено, и редко где можно получить такой опыт. А в реальной жизни иногда проблем с установкой программ бывает больше, чем непосредственно с самой обработкой данных.

Больших трудностей у меня не было. Все домашние задания были составлены по материалам занятий, так что после внимательного просмотра лекций все можно было сделать. С технической частью при необходимости помогали ребята, которые тоже проходили этот курс.

Курс рекомендую, он помогает сформировать представление о работе с NGS-данными и понять, чем больше хочется заниматься в своей научной работе, если вы только недавно заинтересовались биоинформатикой. Более опытные биоинформатики смогут взглянуть по-новому на какие-то моменты обработки данных и, возможно, подобрать более оптимальные варианты решения своих текущих научных задач.

Курс помогает расширить горизонты слушателей и ближе знакомит с задачами биоинформатики, в которых применяются технологии высокопроизводительного секвенирования. Благодаря плавному введению, курс идеально подходит для слушателей без опыта в биоинформатике, но более продвинутые слушатели также могут найти что-то новое и интересное для себя.

Курс идеально подходит для людей с начальным уровнем знаний в области биоинформатики и для тех, кто хочет расширить свои границы биоинформатического анализа и узнать подробнее о других задачах высокопроизводительного секвенирования.

Тарасова Алина

выпускница ФБМФ МФТИ, сотрудница BostonGene

Студентка 2го курса магистратуры МФТИ

Зиганшина Динара
Посмотрите видео-отзывы наших студентов о программе

Преподаватели

Преподаватели программы: ведущие ученые-исследователи из МФТИ, ИТМО, ИОГен РАН.

  • Золотовская Марианна Арсеновна
    Научный сотрудник, лауреат премии Губернатора Московской области для молодых ученых и специалистов
    Лаборатория трансляционной геномной биоинформатики ФБМФ
  • Буг Дмитрий
    Сергеевич
    младший научный сотрудник, врач клинической лабораторной диагностики по совместительству, к.м.н.
    ФГБОУ ВО ПСПбГМУ им. И.П. Павлова Минздрава России
  • Ткаченко Александр Анатольевич
    Младший научный сотрудник в НИИ АГиР им. Д.О.О.
    Институт прикладных компьютерных наук ИТМО
  • Олейникова Екатерина
    Юрьевна
    Биоинформатик группы «РНК-эпигенетики и механизмов геномной стабильности»
    ФИЦ Биотехнологии РАН
  • Ковтун Алексей Сергеевич
    Кандидат биологических наук
    Старший научный сотрудник лаборатории генетики микроорганизмов ИОГен РАН
Куратор программы
Дух Анна Сергеевна
+7 495 576-07-14
dukh.as@mipt.ru
Стоимость обучения

4 причины, почему точно стоит выбрать нашу программу

Лекции и практические кейсы от ведущих ученых-исследователей из МФТИ, ИМБ РАН, ИБХ РАН, Сколтеха.

Актуальные знания и навыки

1

Обучение на платформе электронных курсов МФТИ

Удобная платформа обучения

2

Работа над проектами с лучшими специалистами и единомышленниками

Ценный нетворкинг

3

Обучение онлайн в вечернее время или просмотр лекций в записи

Удобный график

4

Оставьте заявку на программу
дополнительного проф. образования

Заполните форму участника. Мы свяжемся с вами

Оставить заявку
Общее
Школа
Программы обучения
Структура школы
© 2001-2022 Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)
Соц. сети
Языковая версия
Поиск по сайту